当然这种体系的建立并非一朝一夕的事，而现在建立军法科，就是为了这一制度的建立培养班底。另外，军法科跨军事和法律两大系，其人员构成与课程设置尚需仔细斟酌。
对于军事系的学生来源，朱有见暂定为从现有军队中招募。明朝的卫所体制已经腐朽了，要废除这一体制，怎么安置军户是一大问题。一个不小心，就容易不和谐。朱有见下令，从卫所体系下的军户中招募威武兼备的人才入学，给予津贴养家，并且特别规定家属可入民籍，自由选择职业。这样规定的原因之一就是，明朝的军户地位地下到类似于奴隶了。处于此种境况的，还有工匠。
明朝的“户籍制度”非常僵化、非常不合时宜，限制了各个行业的人员流动，最终限制了经济社会的发展。当然设计这套制度的朱元璋，没有学过马克思主义辩证法，朱有见表示无可奈何——当然后世学了辩证法的，把制度搞僵化了的大有人在，不废话。
对于匠籍，朱有见也打算按军户的这套办法，先“抽空”，再废除。
首先迫切需要工匠人才的是火器和造船。明朝处在新旧军事沿革期，不论东西方，火器开始逐步取代冷兵器。不幸的是，因为明朝落后的管理体制，中国在这方面落后于西方国家。
涉及火器，明朝管理体制的问题：工匠地位地下，文化水平不高；没有专门的技术研究机构，所有技术都是口耳相传，而且有些工匠为了维护自己的饭碗，遵从“传男不传女”等古训，与此相对比的是，西方国家形成了专利制度；军事工业实行封建衙门式管理，产品定向供应军队，没有经济刺激力，质检也不认真，粗制滥造，事故频发，造成火器在军队中普及困难。
朱有见想，既然老天爷一不小心让自己这个二十一世纪的现代人穿越回了明朝，那么自己就要作出一番事业来，要用比明朝人早四百年的“远见卓识”来拯救明朝，拯救中国。
要拯救中国，在明朝这个时代，就要鼓励发展工商业，培植资本主义萌芽！！怎样实现这一目标？一方面要提高工匠地位、改善经济待遇；另一方面要允许其自由择业，并且引入市场机制，把死水变活水。朱有见认为，建立一个专利制度是非常必要的。
好多事要做啊！！朱有见每天睡觉前都这样想。
《明报》朱有见每天都要看，对“新政”和实学看不过眼的人大有人在。朱有见的态度就是，你们争论你们的，我干我的。当然这并不是说自己就一条道走到黑。作为一个皇帝，光开言路、虚心纳谏是非常必要的。
但是实际上朱有见现在没法纳这个谏，因为这是从根本上否定实学否定新政。只有顶着各种压力去先做了再说。如果没有一定的担当，那什么事也没法干了。
当然，正如前文所述，还是有很多实学思潮在明朝的民间涌动的。朱有见办实学院的举措让他们看到了光明，积极主动地涌向了“实学”这杆大旗之下。朱有见在新招学院名单中居然看到了黄宗羲、顾炎武这样的名字！！而宋应星也受邀成了实学院的兼职教习！！顺理成章地，《天工开物》、《营造法式》也都成了教科书。
关于律法系，朱有见下诏，让全国各省各府各县的刑名吏员入学。并且声明，凡是入实学院律法系学习的，毕业之后由吏员籍改为官员籍，成为不受地方官管辖的独立的“提刑司”和“按察司”官员。
本来明朝制度，地方政府有提刑按察使司。朱有见经过分析，发现“提刑”智能，类似于后世的刑事侦查加起诉；而“按察”，就是审判了。提刑与按察的分立，就是后世刑事诉讼法上的“控审分离”。这是朱有见司法体制改革的举措之一。
不过这样深谋远虑的举措，明朝人暂时看不透。朱有见好孤独。
律法系的学习，更多的是一种交流，朱有见要求，各地刑名吏员要交流审判经验，将案例记录整理，形成判例汇编，并希望从中找出一些规则，完善明朝的民事立法。
古代的中华法系，以刑为主，民法太不发达了。朱有见认为，要培育资本主义，必须制定民事法律。
另外朱有见托徐光启从外国传教士手中求取的罗马法《国法大全》，也搞到手了。因为其语言简明精炼，基督教传教士们学习拉丁语的教材就是罗马法的条文！！明朝的时候，西方已经重新发现了罗马法，并且对其研究也非常深入了。
朱有见的打算是，先在法学教育中引入罗马法，培养一些具有罗马法思维的法官，再以判例法的形式逐步将其融入中华法系。后世清末的变法修律，虽然快刀斩乱麻，但是也出现了水土不服的后果。并且中华法系的声明就这么一刀被斩断了根脉。
幸而朱有见穿越回这个时代，像英国这样的欧洲国家，罗马法也还只是缓慢渗透入其判例法体系。欧洲大陆各国还盛行习惯法，没有制定民法典。朱有见法律改革的压力不大，而且主动去学习，比被动接受效果要好。朱有见相信，中华法系通过缓慢改革，逐步排除封建因素，从而焕发新生命。
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