唐太宗驾崩后，唐高宗李治继位，这个李治可不像某些电视剧里演的那么窝囊，他实际上颇有“贞观遗风”，遭遇了唐太宗时期对于高句丽的政策，但是迫于继位时有两派党争的形势，唐高宗没有立刻去派兵收拾高句丽，而是采取“怀柔政策”，先稳定内部，在对外扩张。
这个时候朝鲜半岛的形势可谓是新罗要翻天，高句丽被打残了，百济一看新罗起来了所以联合高句丽就攻打新罗，新罗当时的国王叫金法敏，就像唐高宗控诉了百济的卑鄙行径。唐高宗这个时候作为“宗主国”的皇帝，自然不能看着高句丽胡来，所以给百济的“义慈王”下了一道诏书，大概意思就是海东三国都是我大唐的藩属国，你们要停止内斗积极合作，并且严令百济王要把侵略新罗的领土还给新罗王，而新罗所俘虏的百济士兵也要还给百济，朕现在已经通知高句丽的高藏不许他支援你，你要识时务要悬崖勒马不能走向自我灭亡的道路等等说辞。
高丽和百济一听唐朝的劝告，表面上奉行于公实际阳奉阴违，不仅继续攻打新罗，而且还进攻契丹，这一下子唐朝不干了，你说好了撤兵怎么又打起来了，而且还进攻我的直接领土契丹，不知道契丹是我直辖的地区吗，新罗这时候也撑不住了，被高句丽和百济夺了三十三座城市，所以紧急求援唐朝出兵。
唐朝这时候也是延续了之前太宗时期的作法，派少量士兵侵入高句丽的腹地，开始劫掠消耗高句丽的实力，而与此同时派大将苏定方出兵十万与新罗国王金春秋一道攻打百济首都熊津城。给百济受到了强烈的打击基本上是水陆并进，新罗兵从陆上攻击百济，而唐军在水陆攻击百济，百济虽然倾全国之兵抵抗唐罗联军入侵，但是实力不允许加上这个苏定方真的太猛了，所以这个时候守不住了只能投降，百济就灭亡了。
百济一灭亡，唐朝在熊津设置了都督府管辖，并且派兵驻守此地，等于这个时候高句丽的南北都被唐军夹攻，灭亡也只是时间问题。宝藏王二十年（661）唐朝以苏定方为主帅，指挥唐军在灞江与高句丽的军队激战一举大破高句丽，此战之后唐军凯歌猛进直接就包围了平壤城，这个时候泉盖苏文派出他的儿子泉男生率领数万士兵防守鸭绿江来抵御来自于唐军另一支部队契必合力的进攻，虽然高句丽英勇抵抗，但是鸭绿江大家想一到冬天就结冰，这时候咋防也防不住，只能是失败，虽然他本人逃出来了，但是他的士兵都投降了唐军。泉盖苏文毕竟是一个名将，坚持指挥高句丽士兵英勇顽强的抵抗唐军，击退了唐朝包围平壤的士兵，这个时候已经是冬天了，在打下去士兵扛不住，所以这个时候唐军决定班师，高句丽在泉盖苏文的指挥之下成功逃过了一劫，但也只是暂时的拖延亡国时间罢了。
时间到了宝藏王二十五年（666）这个时候高句丽的莫离支泉盖苏文去世，他死后他的三个儿子泉男生、泉男建和泉男产为了争夺世子之位大打出手，泉男建成功的打击了泉男生，使的泉男生逃出了平壤城不得已投降了唐军，唐高宗一看这是机会啊，泉男生都投靠我了可见现在的高句丽就是一个摇摇欲坠的破房子，只要我在这个破房子的门上踹一脚，整个房间就会崩塌。所以立刻出兵派出大将契苾何力为主帅支援泉男生进攻平壤，薛仁贵担任后援，结果一仗又夺得数十座城池，斩杀了五万名高句丽士兵，这一仗泉男生立功了，唐朝为了维持这个地方的稳定封泉男生为平壤道安抚使，玄菟郡公等等官职。
宝藏王二十七年（667）的九月，唐军继续进攻高句丽，这次给了高句丽致命一击唐高宗派出“李世勖”为主帅，李世勖命令薛仁贵为前锋大军开拔矛头直指扶余城，在薛仁贵的奋勇杀敌中扶余城被唐军攻克，接着唐军又攻克了数十座城池占领了鸭绿江附近，并且兵锋直指平壤，在唐军各部的夹攻之下已经占领了高句丽除平壤之外的所有城市，平壤已经成为一座孤城。虽然这时候宝藏王高藏派出泉男产等使者请求投降，无奈他说话不算数泉男建自然是紧闭城门，唐军攻破平壤的时候泉男建见大势已去国家已经灭亡，就企图自杀但是唐军阻止了他的自杀，所以他与宝藏王等高句丽大臣一同被唐军俘虏。
宝藏王二十八年（668），存在了700多年的高句丽正式宣布灭亡从此退出了历史舞台，唐高宗见宝藏王也是被泉盖苏文和泉男建挟持身不由己，所以没有为难他册封他为司空太常伯，泉男生有功所以别封为右武卫大将军，泉男产因为也是被挟持所以封为司宰少卿，泉男建不能饶了他给他发配到了岭南，从此高句丽灭亡，高句丽的通史部分结束。
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