书院主体建筑包括仰圣门、明道堂、大成殿、毓秀阁等。其中毓秀阁原为接待各地访问学者的处所，明道堂为书院讲堂，共设有百间斋室，作为学习者的教室和办公区。后边则是学生的宿舍和休息区，则是由过去的营房改建而成，但是也增加了亭台楼阁，加种了花草树木。
按照赵昺的设想，整个区域基本划分成三个区域，分成甲乙丙叁斋。甲斋作为书院的主体，学生主要来自各地方府学和州学选送的优秀学子，按照‘三舍法’进行管理和选拔，优秀者同样可以免科举试入仕；乙斋则是通过科举取得进士身份者，他们要在这里经过一年的修习，根据分科学习如何做官，经过考试后方能出仕。不合格者再度学习一年后仍不合格，则会被取消入仕资格，只保留进士的身份。
而丙斋则是蒙荫获得官身的官二代们，他们若是想出仕为官，也必须在这里经过两年的学习，经考试合格后方能做官。若是屡考不过关，那也只剩下个荣誉称号了，一辈子别想当官了。另外书院还可以承担些短期培训，例如由京官转为地方官，或是地方官入京，及官员由武转资为文官，都要经过培训，使他们能够了解所在地的风土人情和应注意的事项等等，不至于到了地方两眼一抹黑，什么都不知道。
既然国子监下属武学，那么自然也不能或缺。赵昺以在琼州的新军训练营和水军学堂为基础重组为大宋武学，作为国家的最高武装力量的学府。院址选择在凤凰山南麓，与太学只是一山之隔，以原皇城的真圣殿、殿司衙门、朝马院和都作院及军器库为基础改建而成。
赵昺将学制仍定为两年，一年的基础训练和共同科目学习，一年的专业科目学习。步军仍分为步、骑、炮、辎重四科，但是在专业上也进一步加强了细化和实战化的要求。而水军则分为指挥、帆缆、兵器和导航、辎重五科，他们也将在这里进行基础训练和理论基础的培训，在完成后则第二年转往分设在太湖和杭州湾两地的内河与外海两个基地进行实操学习。此外这里还分设了一所士官学校和参谋学校，培训基层士官和军事幕僚。
另外武学中也同样开设了中级军官和高级军官进修班，作为新晋职官员入职前的培训，他们将在这里学习相关职务和专业更深层次的军事理论知识，及管理和指挥、调度部队，组织战斗和战役的相关知识，完成层次上的提升。
如今武学的生源除了来自各部推荐的优秀士兵和基层军官，还有部分有意从戎投军的士子，且这部分人随着军人物质和政治待遇的提高，已经有越来越多的士子参加一年一度的武学招生考试，进入军中渐渐成为骨干，逐步改变了军队的结构。
在世人看来虽然文武两学同属国子监管理，但是无论是朝臣，还是国子监的官员都不如此认为。按照陛下的诏令，在领导上太学属礼部、武学属兵部，不过同属于国子监进行管理。可兵部和国子监却皆说自己管不了武学，大小事务皆要奏请陛下批示，即便在小皇帝修养期间也是如此，从未有人敢于挑战陛下的威严。
因此不免有人私下言称，当今金榜题名者方可称天子门生，而进了武学大门那就可成为天子门生了。而朝臣们也以为小皇帝之所以将武学名义上划归国子监管辖，不过是因为他们拥有授予上舍生免于礼省部试便可获得举人资格的权力。如此一来武学学生修完学业后，便同时有了资历，可为以后转资为文官打下基础……
而赵昺他们要去的射箭的地方就是设在武学中的校场，这里原本就有设在山腰的上校场和山顶的下校场及殿司衙门中的大校场。三个校场当属原殿司衙门大校场最为完善，也是武学本部所在之地，所以赵昺将此处设为此处演射之所。
“陛下，请先射！”武学早已得到通报，陛下今日前来演射，因而校场中早已立起了靶垛，备好了弓矢。小憩之后，赵孟锦递过一把弓笑着道。
“这弓是不是小了些？”赵昺拿过弓来，用手指钩住弓弦轻松的拉开，又轻轻的放回道。
他也是到了这个时代才知道，电视剧中那些武将、大侠试弓，都是双膀较力将弓拉开，然后松开手指，弓弦发出声绷响，以显示其力大无穷。其实那只能说明，这人根本不懂得如何射箭，放空弦其实是最容易将弓损坏，没有一个武将会拿保命的家伙会玩儿空射的，除非是有意毁损对手的弓。进一步想所为的‘惊弓之鸟’这句成语都可能是臆想出来的。
“陛下，这已经是五斗弓了，正合少年使用！”赵孟锦有些意外地道。
“换一张来！”赵昺将弓递给其，以不容置疑的口吻道。
“陛下，用这张吧！”江钲从弓架上拿过张弓递过去道。
“嗨！”赵昺接过，两臂一较力，仍然将弓轻松来开，又将弓放松摇摇头道，“还是小了些。”
“陛下，这已经是九斗弓，军中的弓手常用的也只有此数了。臣满力也只能用一石五斗之弓！”江钲有些吃惊地道。
“那就换个与汝同等的石半之弓！”赵昺笑笑道。
“陛下年纪尚轻，万勿逞强，若是伤了筋骨可就不美了！”刘洙也上前劝道，他此前也是擅射的，因而十分清楚强行拉硬弓的害处，而石半之弓对于小皇帝的岁数在他看来已经是极限了。
“朕知道轻重，试试可否！”赵昺笑着道，因为他也不知道自己到底能开多大的弓，但是在有了火枪后，元妙老和尚还是在逼着他练箭，想把他打造成像太祖一样弓马娴熟的武皇帝。
“陛下一定要适可而止，千万不要勉强！”江钲为小皇帝换了把弓，还是不放心的嘱咐着道。
“好！”赵昺这次没有试弓，拿过一支雕翎箭搭在弦上，叫了声好却也没有用猛力拉弓，而是缓缓加力将弓来开，对准了靶垛略微瞄准便撒开弓弦放箭。
‘镗啷啷……’箭矢飞射而出，正中靶垛，那边验靶的军士敲响了铜锣，表明正中红心。
“陛下神射啊！”众将见了齐声欢呼道，不过更多的是长舒了口气。
“只五十步尔，再换张两石的弓试试，将靶垛再后移三十步！”赵昺知道大家是为了讨自己欢喜，才将靶垛放在了五十步内，而他却想知道自己的实力到底如何……
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