这个时期，本来是晓袭击各大忍村，收集尾兽的时期，然而因为自来也三年前就找长门谈了人生与理想，所以晓基本没什么动作。
基本上因为柳莺梓的关系，整个剧情已经彻底崩了。
当鸣人和佐子回来的时候，身为五代火影的纲手便发布命令，让自来也带着鸣人、佐子和卡卡西一起行动，去对付晓组织——主要是对付以宇智波带土那一系的人马。
这件事就要靠长门帮忙了，所以自来也当即联系上了长门。
长门得知木叶要采取行动的时候，顿时有了一种‘终于开始行动，已经等得不耐烦’的感觉，然后就配合木叶一方行动起来。
结果，长门的背叛早就被发现了，然后在行动的时候，带土先一步行动，找到了大蛇丸并与大蛇丸展开合作。
也不知道土哥许了什么诺给大蛇丸，反正在付出了一大堆东西后，大蛇丸同意和土哥合作，两人一起联手，用秽土转生联手袭击长门，在木叶的人赶到之前将长门杀了并夺走了轮回眼。
这下晓组织内乱了，然后带土揭开身份，以宇智波斑的名义拦下晓组织的控制权，让剧情走回原点，晓组织在他的命令下开始袭击各大村子夺取尾兽。
总之，在发生了一系列事后，大蛇丸和佐子对上了，并在带土的帮助下准备夺取佐子的身体，还差一点成功了。
只不过最后柳莺梓在佐子体内留下的力量起了作用，佐子绝地反扑，反灭了大蛇丸。而药师兜看大蛇丸嗝屁，一下子崩溃了，拉着大蛇丸的尸体就去求合♂体，最后和原著一样变成了大蛇兜，然后和带土联手，与整个忍界宣战。
到了这一步，基本上回到了原点，只不过原著中本来死了的人没死，主要是主角一方的人马，比如自来也没死，再比如宇智波鼬也没死，而是被救了回来并回到木叶一方，毕竟佐子没叛逃，而她与鸣人的实力也远超原著同期，而这都是柳莺梓带来的蝴蝶效应。
总而言之，第四次忍界大战开始了，和原著一样，就是忍界大军一方对抗秽土军团和白绝军团。
在大战前夕，忍者联军占据绝对的优势，虽然像长门这些超级高手都被秽土召唤出来作为打手，但架不住主角一方开挂的太多，所以最终的结果就是秽土军团和白绝军团被吊打。
然而，当宇智波斑这个挂逼中的挂逼被秽土转生召唤出来的时候，结果就不同了，其以绝对的力量碾压了忍者联军一方，并和带土合力召唤出了十尾。
最重要的是，原著中大蛇丸是复活了的，但这个世界的大蛇丸没能复活，没能复活就代表挂了的四位火影没机会出场了。
不，应该说三位火影，因为三代火影还没死，并成了忍者联军的总司令——就是坐镇后方指挥的那种，毕竟谁也不指望这位老人家在前线火拼。
只是当秽土斑被召唤出来的时候，三代火影就无法在后方坐镇了，毅然参加了前线大战，可惜并没有什么卵用，毅然是被吊打。
总之，整个战况基本上和原著没什么不同，带土先成了十尾人柱力装逼了下，可惜架不住主角一方开挂更变态，而且自带无敌嘴炮属性，所以带土最后被嘴炮洗白了。
接着宇智波斑借助黑绝控制带土，让带土使用轮回天生之术将自己复活，然后复活的斑爷给自己装上轮回眼，一下子就超神了，吊打主角一方，并成了十尾人柱力。
和原著不同的是，九尾查克拉只是夺取了柳莺梓留给鸣人的那部分，而柳莺梓本身依然沉睡，所以鸣人被夺取查克拉后没死，佐子也没作死的去单杀宇智波斑，而是全心全意照顾鸣人，免得鸣人出事。
然后鸣人和佐子再次开挂，激活老爷爷模式——六道仙人显灵，将体内的阴阳查克拉完全激活，并最终和十尾人柱力的宇智波斑大战三百回合，最终将宇智波斑吊打。
然而还没等两人高兴，真正的幕后黑手——黑绝出招，借助宇智波斑的身体将最终BOSS大筒木辉夜召唤出来了。
这就是最后的决战，鸣人和佐子对抗大筒木辉夜，其他人全部打酱油，没有人能插手这基本上和赛亚人PK没多少区别的战斗了，因为其他人全部中招，被无限月读给控制了，包括原著中在最终之战帮了鸣人和佐子大忙的卡卡西等人——因为一二四代火影没用秽土复活，所以全部扑街了。
所以，鸣人和佐子因为各种蝴蝶效应的关系，在最后变成了孤立无援的战斗，而大筒木辉夜比他们厉害多了，将两人直接吊打，最后鸣人为了救佐子，被大筒木辉夜用给棍子给贯穿了心脏。
这妥妥的要死的节奏啊！
不过，柳莺梓沉睡前早就在鸣人身上留下了一缕保命的力量，一旦鸣人受到真正的致命伤害，那股力量就会激活，将鸣人的致命伤治愈，而她也会随之苏醒。
不错，因为这次打击，柳莺梓苏醒了。
苏醒的柳莺梓瞬间知道发生了什么事，当即从鸣人体内飞出，在大筒木辉夜面前现身了。
见到柳莺梓的瞬间，所有人都是一愣，柳莺梓看着大筒木辉夜，回头看了看受伤不轻的鸣人和佐子道：“看样子你们打不过她啊。”
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